Все аналогичные программы как раз и привязаны к выполнению тех или иных действий при наступлении события, т.е. при совпадении запрограммированных координат с текущими координатами мыши (например).
Вам, по всей видимости, нужна привязка к конкретным окнам в каких координатах они (окна) не формировались бы. А это уже совершенно иной уровень программирования и кликаньем мышки тут не обойтись, да еще чтобы .exe файл на выходе получился.
Вряд ли Вы найдете готовое решение для изложенной задачи.
Хотите кого-то обучить!? - сделайте банальный демонстрационный (обучающий) видеоролик. В нужном месте включил паузу и повторил действия, если туго идет обучение. Либо принудительно переводите мониторы Ваших ПК к одному разрешения при запуске программы.