Я например, склеиваю mov-файлы тем же QuickTime Pro 7.1.3. Делаю так:
Проигрываю мов до конца. Открываю в новом окне второй и из меню Edit выбираю Select All. Копирую и вставляю в конец первого мова. И т.д. Потом сохраняю суммарный файл без пережатия (Save as...) И все.